所有的蛋白质都是由氨基酸合成过程产生的，这个过程产生了用来合成蛋白质的氨基酸。然而，自然界很少简单到把一种功能限制在一个王国里，所以有一些溪流为食物链提供蛋白质。
例如，为海洋生态系统创造氨基酸和碳水化合物的浮游植物，包括严格说来不是植物的蓝藻和原生生物。
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氨基酸在植物中的合成
植物和其他光合生物利用光合作用产生葡萄糖，葡萄糖是整个地球代谢能量的主要来源。植物利用氧、碳(来自二氧化碳)和氢(来自水)来制造糖，这些糖被合成为复杂的碳水化合物，如淀粉和纤维素。
为了制造氨基酸，它们还需要获得氮，虽然大气中富含氮，但大多数陆地植物无法从空气中获得。通过观察它们氮的来源，我们发现了一些可能的交换，即从其他生物体中得到的氨基酸全部交换到植物中。
固氮细菌
一些固氮细菌在植物的根上与植物共生。植物为细菌提供生存所需的糖分，而细菌通过从空气中吸收氮并将其与氨结合来回报细菌，而氨可以被植物用来制造氨基酸。还有一些证据表明，植物可以直接从细菌中吸收氨基酸。特别是豆科植物(豆科植物)可以寄主这些细菌，并利用它们使豆科植物成为食物链中蛋白质的最佳来源之一。你知道这些植物有豆类、扁豆、鹰嘴豆、大豆和花生。
为植物提供氮的其他来源
非固氮剂，也就是大多数植物，直接从土壤或菌根真菌(共生附着在植物根上的真菌)中获取氮，这些真菌从土壤和腐烂的有机体中清除可用的氮。再说一次，尽管植物没有直接寄主细菌，但它们可能能够从土壤中吸收全部氨基酸，其中大部分来自这些细菌和真菌来源。
有些细菌生活在动物的消化系统中，并在那里产生氨基酸
草和草本植物是普通的蛋白质来源，但是像牛和羊这样的动物有很大的内脏来磨碎和分解植物，为细菌制造食物。反过来，细菌把纤维素分解成对自身和动物都有用的能量，把蛋白质分解成氨基酸，通过固定氮和进行氨基酸合成来制造自己的氨基酸。当细菌死亡并被消化时，它们为动物提供蛋白质营养。
这就是反刍动物(利用细菌在肠道中发酵纤维素的动物)在吃低蛋白的草和植物时，如何构建巨大而肌肉发达的身体。它们的粪便富含氮，可以给植物施肥，它们的身体也被其他动物吃掉，为食物链提供能量。
