反式脂肪是好是坏？反式脂肪有没有什么功效？国家科学院为美国和加拿大政府提供营养科学方面的建议，用于公共政策和产品标签项目。他们2002年的能量、碳水化合物、纤维、脂肪、脂肪酸、胆固醇、蛋白质和氨基酸的膳食参考摄入量包含他们关于反式脂肪消费的发现和建议(摘要)。
他们的建议基于两个关键事实。首先，“反式脂肪酸不是必需的，对人类健康没有已知的益处”，无论是动物还是植物来源的。第二，虽然饱和脂肪和反式脂肪都增加低密度脂蛋白的水平，反式脂肪也降低高密度脂蛋白的水平；从而增加冠状动脉疾病的风险。国家科学院担心“饮食中的反式脂肪酸比饱和脂肪酸对冠状动脉疾病更有害”。这一分析得到了2006年《新英格兰医学杂志》(NEJM)科学评论的支持，该评论称“从营养的角度来看，食用反式脂肪酸会导致相当大的潜在危害，但没有明显的益处。”
基于这些事实和担忧，国家科学院得出结论，反式脂肪消费没有安全水平。反式脂肪没有足够的含量、推荐的日摄入量或容许的上限。这是因为反式脂肪摄入量的任何增加都会增加患冠状动脉疾病的风险。
尽管如此，美国国家科学院的饮食建议并没有包括从饮食中消除反式脂肪。这是因为反式脂肪在许多动物食品中以微量的形式自然存在，因此如果不进行适当的营养计划，从普通饮食中去除反式脂肪可能会带来不良的副作用和营养失衡。因此，国家科学院“建议反式脂肪酸的摄入量应尽可能低，同时摄入营养充足的饮食”。像美国国家科学院一样，世界卫生组织也试图平衡公共健康目标和反式脂肪消费的实际水平，并在2003年建议反式脂肪的摄入量不得超过总能量摄入量的1%。
美国国家乳制品委员会声称，动物食品中的反式脂肪与部分氢化油中的反式脂肪类型不同，似乎没有表现出同样的负面影响。虽然最近的一项科学综述同意这一结论(指出“现有证据的总和表明，食用反刍动物产品中的反式脂肪对公众健康的影响相对有限”)，但它警告说，这可能是由于食用动物来源的反式脂肪比食用人造脂肪少。
最近的调查(独立于乳制品行业)发现，在2008年荷兰的一项荟萃分析中，所有反式脂肪，无论是天然的还是人造的，都同样会提高低密度脂蛋白和降低高密度脂蛋白水平。然而，其他研究表明，对于共轭亚油酸(CLA)等基于动物的反式脂肪，结果有所不同。尽管共轭亚油酸因其抗癌特性而闻名，但研究人员也发现，共轭亚油酸的顺式-9，反式-11形式可以降低心血管疾病的风险，并有助于对抗炎症。
